Карачаево - Черкесский республиканский территориальный фонд ОМС был образован 24 августа 1993 года, в соответствии с Постановлением Президиума Верховного Совета КЧР от 24.08.2003 г. № 48.

В 2011 году Карачаево-Черкесский республиканский территориальный фонд обязательного медицинского страхования переименован в Территориальный фонд обязательного медицинского страхования Карачаево-Черкесской Республики. В настоящее время действует на основании Положения, утвержденного постановлением Правительства Карачаево-Черкесской Республики от 31.05.2011 № 153 «Об утверждении Положения о Территориальном фонде обязательного медицинского страхования Карачаево-Черкесской Республики.

Джанкезов Айдемир Сеитбиевич назначен на должность директора Территориального фонда обязательного медицинского страхования Карачаево-Черкесской Республики на основании Постановления Правительства Карачаево-Черкесской Республики от 28.09.2015г. №96.

Штатная численность ТФОМС Карачаево-Черкесской Республики - 63.